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叶绿体基因组研究连登Int J Mol Sci杂志(IF = 4.183)

发稿时间:2019-09-16来源:ca88会员登录入口生物


摘要:叶绿体随机测序最新研究进展

1、题目:Comparative Analysis of two Sugarcane Ancestors Saccharum officinarum and S. spontaneum based on Complete Chloroplast Genome Sequences and Photosynthetic Ability in Cold Stress(基于叶绿体基因组序列和低温胁迫下光合能力的祖先甘蔗Saccharum officinarumS. spontaneum的比较分析)

发表时间:2019年8月


多倍体甘蔗复杂的核基因组阻碍了甘蔗的改良进程。相比之下,叶绿体基因组则更小更简单,除了是植物光合作用的场所,它在进化过程中还发展出了其他功能,如应对环境压力的耐受性。本研究对甘蔗两个祖先种Saccharum officinarumS. spontaneum的叶绿体基因组进行了二代随机测序,并对这两个种的基因组和光合能力进行了比较分析,实验结果为甘蔗叶绿体的生物学机制及系统发育和进化研究奠定了基础,有助于现代甘蔗光合能力和抗寒性的遗传改良。


甘蔗Saccharum officinarumS. spontaneum的叶绿体基因组圈图


两个甘蔗叶绿体基因组的共线分析


2、题目:Cuscuta Species Identification Based on the Morphology of Reproductive Organs and Complete Chloroplast Genome Sequences(基于繁殖器官形态和叶绿体基因组序列的菟丝子物种鉴定)

发表时间:2019年6月


Cuscuta Species Identification Based on theMorphology of Reproductive Organs and Complete Chloroplast Genome Sequences

菟丝子属(旋花科)包含有众所周知的寄生植物,会造成大面积的作物损失。此外,其种子可以入药。尽管菟丝子属物种很重要,但用肉眼很难区分这些植物。在本研究利用繁殖殖器官的形态特征和叶绿体基因组的分子特征来区分C. chinensisC. japonica。叶绿体基因组的分析揭示了两种植物叶绿体基因组长度和基因顺序的巨大差异。尽管两种植物都表现出大量的叶绿体基因缺失和基因组重排,但在亚属中表现出高度相似的结构。本研究结果为菟丝子的分类、系统发育和进化分析以及中草药的准确鉴定提供了有用的信息。


七种菟丝子的线性叶绿体基因组图谱比较


菟丝子属和甘薯属的系统发育分析


3、题目:The Complete Chloroplast Genomes of Punica granatum and a Comparison with Other Species in Lythraceae(石榴叶绿体完整基因组及其与千屈菜科其他植物的比较)

发表时间:2019年6月


石榴是干旱半干旱热带和亚热带地区最受欢迎的果树之一。在本研究中,研究者鉴定了不同表型石榴品种的三个完整叶绿体基因组。之后结合以前的两个报道分析了石榴叶绿体基因组的序列多样性。结果表明,该序列多样性极低,未检测到信息位点,表明叶绿体基因组序列可能不适合研究石榴基因型的遗传多样性。此外,本研究分析了密码子使用模式,并确定了潜在的核糖核酸编辑位点。与千屈菜科其他物种的叶绿体基因组比较分析显示,基因含量和组织高度保守。基于位点特异性模型,共检测出11个位点选择积极的基因,其中大部分是光合作用相关基因和遗传系统相关基因。根据完整的叶绿体基因组确定了石榴的分类位置。系统发育分析表明,石榴与千屈菜科其他物种形成单枝,具有较高的支持价值,其完整的叶绿体基因组为了解系统发育位置提供了有价值的信息。


千屈菜科五个叶绿体基因组的共线性分析

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