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2019国自然最全m6A RNA甲基化解析

发稿时间:2019-08-24来源:ca88会员登录入口生物

一年一度的国自然基金资助项目于上周放榜各大平台陆续开始解析国自然项目内容m6A RNA甲基化作为近三年来最火热的研究方向之一,国自然今年立项数目更是呈爆发式增长,ca88会员登录入口生物市场部从多个关键词入手,发现2019m6A RNA甲基化项目共计179,比2018年增长了一倍之多。

 

从项目类型划分,重点项目3项,面上项目89项,青年基金81项,地区基金6项。

 

 

其中部分老师在相应的领域已经有m6A相关的重要成果发表:

 

 

 

从科研单位划分,共计76个单位拿到了资助项目,中山大学在m6A领域仍然独占鳌头,拿到了20项,南京医科大学以17项占据次席,上海交通大学9项,华中科技大学7项,浙江大学6项,武汉大学6项,中南大学6项,哈尔滨医科大学5项,同济大学5项,郑州大学5项。

中山大学在国内一直是m6A修饰表观领域的领跑者,作为第一单位或合作单位,2019年以来就有近26篇文章发表,其中包括1Nature (Histone H3 trimethylation at lysine 36 guides m6A RNA modification co-transcriptionally)1Cell Research (Transcriptome-wide reprogramming of N6-methyladenosine modification by the mouse microbiome)1Science Advances (Single-base mapping of m6A by an antibody-independent method)2Nature Communications3Molecular Cancer

 

 

从研究方向划分,绝大多数项目都是与医学(健康或疾病)相关,农口相关的项目仅10项。医学疾病领域,肿瘤仍然是最主要的方向,约77项,最常见的包括肺癌、肝癌、胃癌、乳腺癌和结直肠癌等。研究的主要内容包括m6A修饰如何影响肿瘤的发生、增殖、转移、耐药等。

 

 

其它主要的疾病方向包括心血管疾病(动脉粥样硬化、心肌梗死、心肌肥大、心肌炎症等共15项,部分如下图)、神经脊髓相关11项)、骨相关9项)、糖尿病7项)、胚胎发育分化7项)、孕期疾病4项)、肺部疾病3项)、脂肪代谢3项)、肾脏疾病3项)、脓毒症2项)、银屑病2项)等。

 

 

从研究思路上看,今年m6A RNA甲基化最大的特点是非编码RNA相关的内容大幅增加,医学相关共计47项!其中主要包括三个研究方向:

1. lncRNAcircRNA本身的m6A修饰

2. m6A修饰影响miRNA的成熟过程(primary miRNAm6A修饰)

3. 非编码RNA作为上游因子调控m6A修饰相关的明星分子,从而影响某些mRNA的修饰

 

 

比如m6A修饰影响miRNA的成熟过程,得益于2015年两项重要的奠基性的成果,1Nature1Cell分别证实了m6A修饰能够影响miRNA的加工成熟过程以及发现了pri-miRNA m6A修饰的reader蛋白HNRNPA2B1

 

 

2019年以来国内学者在非编码RNA m6A修饰相关方向也有一些重要成果,如林东昕院士课题组发现吸烟能够通过m6A修饰的途径诱导miR-25-3p的成熟,从而促进胰腺癌的进展,相关成果于20194月发表在Nature Communications上。

 

 

如中山大学药学院王红胜课题组发现m6A修饰的lncRNA RP11能够通过翻译后上调Zeb1蛋白的表达促进结直肠癌的进展,表明lncRNA的甲基化可能在结直肠癌中发挥重要作用,相关研究成果发表在20194月的Molecular Cancer上。

 

 

总结:3年来m6A RNA甲基化修饰在疾病相关的各个领域都有新的重要的发现,m6A修饰确实参与到多种疾病的发生发展过程,而调控m6A修饰的因素众多,包括多种甲基化修饰酶(writers)、去甲基化修饰酶(erasers)、甲基化修饰识别蛋白(readers)、影响这些酶的上游因子等,同时各种RNA都有可能发生m6A修饰。因此RNA甲基化方向可以设计多种多样的方案,特别适合于国自然机制研究的胃口

 

 

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ca88会员登录入口生物具有多年基因组、转录组和表观组等多组学检测与分析的经验,m6A RNA甲基化作为表观领域的一大热点,ca88会员登录入口生物可为您提供m6A整体水平定量,结合RNA-seqm6A MeRIP-seq挖掘潜在的受m6A调控酶影响的靶点,同时可对靶点进行MeRIP-qPCR验证。生信团队亦可提供个性化的数据库挖掘与生信分析内容。

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